Медвежонок Паддингтон обосновался в Лондоне и стал частью семьи Браунов. Живя в уюте и гармонии, он решает навестить свою любимую тётушку Люси в Перу. Вместе с Браунами и миссис Бёрд Паддингтон отправляется в далёкое путешествие. Однако по прибытии выясняется, что тётушка Люси исчезла из дома престарелых медведей. Она отправилась в загадочное приключение по джунглям Амазонки. Паддингтон и его друзья начинают спасательную операцию, проходя через захватывающие испытания в горах и тропических лесах, чтобы найти и вернуть тётушку Люси.